In den letzten Jahren hat sich das Egg Museum gänzlich Sonderausstellungen verschrieben und gibt damit Einblick in die unterschiedlichen Themen der Region Bregenzerwald. Sie entstehen zumeist in Kooperation mit den verschiedenen Institutionen und Vereinen der Region oder des Landes. Die Sonderausstellungen werden jeweils durch ein umfangreiches Rahmenprogramm ergänzt. Das jeweils aktuelle Ausstellungsprogramm ist unter eggmuseum.at zu finden.